אַגְרוֹן

טלפון

+86-0755 2308 4243
כתובת

חדר 309, בניין Meihua, פארק התעשייה של טייוואן, מס' 2132 Songbai Road, מחוז באואן, שנזן, סין
דוא

sales@biorunstar.com

אַגְרוֹן

2-אבז

2-Abz - 2-Aminobenzoyl, מתחבר בדרך כלל עם 2,4-dinitrophenyl (Dnp) או 3-nitro-tyrosine (NitroTyr) ליצירת זוגות פלואורופור/קונצ'ר. עירור ב-320 ננומטר, פליטה ב-420 ננומטר.

3-אבז

3-ניתן לראות את Abz (m-aminobenzoic acid) כחומצת אמינו. כאשר חומצה m-aminobenzoic משולבת בשרשראות פפטידים, זה גורם לסיבוב נוקשה.

4-אבז

4-Abz (p-Aminobenzoic acid, PABA), בהיותה נגזרת טבעית של חומצה בנזואית, יכולה לשמש גם כמרווח ליניארי קשיח.

אבו

Abu, L- -Aminobutyryl ((S)-2-Amino-butanoyl), חומצה אמינו-בוטירית, היא נגזרת של חומצת אמינו. בשל הדמיון המבני שלו לחומצות אמינו טבעיות, הוא משמש לעתים קרובות בעיצוב וסינתזה של פפטידים ומימטיים פפטידים.

Ac מייצג אצטיל. אצטילציה N-טרמינלית היא שינוי מייצב שכיח לפפטידים בטבע.

Acm

Acm, Acetamidomethyl, ניתן להסיר באמצעות Hg(II) או Ag(I). זוהי אחת מקבוצות ההגנה התיול הנפוצות עבור ציסטאין בעת סינתזה של פפטידים עם קשרי דיסולפיד מרובים.

ACTH

ACTH (הורמון אדרנוקורטיקוטרופי) הוא הורמון המופרש מהיפופיזה הקדמית וממריץ את קליפת האדרנל לייצר קורטיקוסטרואידים.

עדה

Aad (L- -aminoadipic acid) היא חומצת אמינו שאינה חלבונית. המבנה שלו דומה לחומצה גלוטמית (Glu), עם קבוצת מתילן נוספת בשרשרת הצדדית שלה.

AEA

(2-Aminoethoxy) חומצה אצטית, הידועה גם בשם גליצין אתיל אסטר או גליצין אתילמיד, יכולה לשמש כמרווח או מקשר בסינתזה של שינוי פפטידים.

Adpoc

1-(1'-adamantyl)-1-מתיל-אתוקסיקרבוניל, קבוצת הגנה אמינו נטולת חומצה בסינתזת פפטידים, ניתנת לביטול ההגנה על ידי 3% TFA/CH2Cl2

AFC

AFC (7-Amino-4-trifluoromethylcoumarin) היא תרכובת ניאון עם עירור של הקומרין המשוחרר ב-395-400 ננומטר, פליטה ב-495-505 ננומטר.

צבירה

מינים בעלי משקל מולקולרי גבוה יותר נוצרים עקב הידבקות לא קוולנטית של מינים קטנים יותר. בחלבונים בפרט, אגרגציה היא צורה של דנטורציה שיכולה להתרחש על משטחים לא קוטביים בעלי מבנים משניים, כגון אלו היוצרים בדרך כלל אינטראקציות תוך מולקולריות וקבורות בסליל ה-ו-של החלבון. מולקולות מקיימות אינטראקציה זו עם זו, ולפעמים יוצרות צורות פולימולקולריות בלתי מסיסות. צבירה מנוגדת לאוליגומריזציה, האינטראקציה הרגילה של חלבונים מקומיים מקופלים נכון ליצירת פולימרים מסדר גבוה יותר.

AHX

AHX, Aminohexanoyl,6-Amino hexanoic acid, גם בקיצור Aca או LC, מובא בדרך כלל כמרווח לא קוטבי קצר בין ביוטין, פלואורפורים ורצפי פפטידים.

אייב

2-חומצה אמינואיזובוטירית היא חומצת אמינו נדירה שאינה חלבונית שהיא תוצר סופי של חילוף החומרים של פירמידין ומופרשת בשתן ונוכחת בחלק מהאנטיביוטיקה שמקורה פטרייתי. משמש גם להחלפת חומצות אמינו טבעיות לסינתזת פפטידים.

אלכוהול

אלכוהול הם אותם תרכובות אורגניות המאופיינות בנוכחות של קבוצת הידרוקסיל אחת, שתיים או יותר (-OH) המחוברות לאטום הפחמן בקבוצת אלקיל או בשרשרת פחמימנית. אלכוהול פפטיד הם תרכובות קריטיות מבחינה קלינית שאינן נחקרות מספיק במחקרי קשרי מבנה-פעילות (SAR) לצורך גילוי תרופות. לדוגמה, DAMGO הוא אגוניסט לקולטן לאופיואידים שהשתנה על ידי אלכוהול במסוף ה-C, עם הרצף של Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. יש לו סלקטיביות וזיקה גבוהים לקולטן μ-אופיואיד.

אלדהיד

אלדהיד הוא תרכובת אורגנית שבה קבוצת הקרבוניל מחוברת לאטום פחמן בקצה שרשרת פחמן. פפטיד אלדהידים הם כלים חשובים בביוכימיה ובביולוגיה כימית לעיכוב והשבתה כימית של פרוטאזות.

אלוק

Aloc - Allyloxycarbonyl, קבוצת אמינו הגנה (מקוצר גם Alloc). ניתן להסיר את ההגנה באמצעות Pd(PPh3)4.

מחלת אלצהיימר

מחלת אלצהיימר, המסומנת על ידי פלאק עמילואיד וסבך טאו, נובעת מבעיות בתפקוד הסינפטי ובעיות בנתיבי הפינוי, הגורמת לפגיעה קוגניטיבית.

AMC

7-אמינו-4-מתילקומרין (AMC) הוא בדיקה ניאון נפוצה לתיוג פפטידים במחקרי פרוטאז. הצימוד שלו לפפטיד מרווה את האות הפלורסנטי, וה-AMC המשוחרר לאחר פיצול פרוטאז יכול לכמת את פעילות האנזים, עם מקסימום עירור/פליטה של 345/445 ננומטר. לדוגמה, הפפטיד הפלורסנט המצע המועדף לקביעת הפעילות דמוית הטריפסין של פרוטאזום מטוהר, עם הרצף: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

ANP

פפטיד נטריאורטי פרוזדורי (ANP), הורמון המיוצר ומשוחרר על ידי פרוזדורי הלב בתגובה להגדלת נפח הדם והלחץ. זה מתפקד כדי לווסת את מאזן הנוזלים ואת לחץ הדם על ידי קידום הרחבת כלי הדם, הגברת ייצור השתן (diuresis), והפחתת ספיגה מחדש של נתרן בכליות. פעולות אלו עוזרות לנטרל את ההשפעות של לחץ דם גבוה ועומס נוזלים בגוף.

פפטידים אנטיגנים

פפטידים אנטיגנים הם רצפים קצרים של חומצות אמינו שמקורם בחלבונים או ביומולקולות אחרות המעוררות את התגובה החיסונית של האורגניזם. פפטידים אלו מזוהים על ידי מערכת החיסון כזרים או זרים לגוף, מה שמוביל להפעלה של תאי חיסון כגון תאי T ותאי B. פפטידים אנטיגנים ממלאים תפקיד מכריע בתגובות חיסוניות, כולל ייצור נוגדנים אדפטיביים ופיתוח זיכרון חיסוני. הם נחקרים בהרחבה באימונולוגיה ובפיתוח חיסונים בגלל הפוטנציאל שלהם לעורר תגובות חיסוניות ספציפיות נגד פתוגנים או תאים לא תקינים.

פפטיד מסועף א-סימטרי

ניתן להשיג את הסינתזה של פפטידים אסימטריים עם 2, 4 ו-8 ענפים על ידי הכנסת ליזין, ארגינין או חומצה גלוטמית באופן אסטרטגי לרצף הפפטידים.

דימתילארגינין אסימטרי (ADMA)

דימתילארגינין א-סימטרי (ADMA, Arg(Me)2) הוא תרכובת כימית הקיימת באופן טבעי ומעכבת אנדוגנית של סינתאז תחמוצת החנקן (NOS). Fmoc-Arg(Me)2-OH (אסימטרי) יכול לשמש ישירות לסינתזה של פפטידים המכילים דימתילארגינין א-סימטרי.

Ava

5-חומצה אמינוולרית, יכולה לשמש כמרווח או מקשר בסינתזה של שינוי פפטידים.

בנזילוקסימתיל

Benzyloxymethyl (Bom) היא קבוצת הגנה אימידאזול בלתי תקינה לחומצה המשמשת בתהליך Boc-SPPS לפפטידים המכילים היסטידין. Benzyloxymethyl מייצר פורמלדהיד תגובתי מאוד לאחר טיפול בחומצה. לכן, Bom הוא המבקע הטוב ביותר בנוכחות Cys, methoxyamine או תרכובות אחרות המגיבות עם אלדהידים.

חומצת אמינו בטא ( ).

לחומצות אמינו קבוצת האמינו שלהן מחוברת לפחמן - שהוא אטום הפחמן השני הרחק מקבוצת הקרבוקסיל. הנוסחה המבנית הכללית של חומצת אמינו יכולה להיות מיוצגת כך: R−CH(NH2)−COOH

BNP

פפטיד נטריאורטי מסוג B (BNP), הורמון המיוצר בעיקר על ידי חדרי הלב בתגובה למתיחה מוגזמת של תאי שריר הלב. הוא ממלא תפקיד מכריע בוויסות לחץ הדם ומאזן הנוזלים, בעיקר על ידי קידום הרחבת כלי הדם והגברת הפרשת הנתרן דרך הכליות.

בוק

t-Butyloxycarbonyl (Boc) היא קבוצה המגנה על חומצה-לבילאה-אמינו בסינתזת פפטידים, ניתנת לפירוק על ידי TFA/מתילן כלוריד (1:1), HCl באתיל אצטט או דיוקסאן, 98% חומצה פורמית.

Bpoc

2-(4-Biphenylyl)isopropyloxycarbonyl (Bpoc) היא קבוצת הגנה חומצית-לבילאה-אמינו בסינתזה של פפטידים, ניתנת לפירוק באמצעות 1% TFA/מתילן כלוריד.

פפטיד מסועף

ניתן להשיג פפטידים עם 2, 4 ו-8 ענפים על ידי הכנסת ליזין, ארגינין או חומצה גלוטמית באופן אסטרטגי לרצף הפפטידים.

בסי

t-Butyldimethylsilyl (TBS או TBDMS) היא קבוצת הגנה על הידרוקסיל התואמת Fmoc-SPPS. הוא עמיד לחומצה וניתן לבקע אותו באופן סלקטיבי על ידי יוני פלואוריד.

בז - בנזויל

בנזואיל הוא קבוצת אציל המוכנסת לרוב בקצה ה-N של הפפטידים. הוא פחות קוטבי מאצטיל (Ac) ויכול להיות כשינוי קבוע.

בז"ל - בנזיל

בנזיל (Bzl) שארית אלקיל וקבוצת הגנה על שרשרת צד המשמשת לחסימת אלכוהול (Ser, Thr, Hyp) בסינתזה של פפטידים. ניתן לפצל אותו על ידי חומצות חזקות או הידרוגנוליזה קטליטית (למשל מימן/Pd).

CCK

Cholecystokinin (CCK) הוא הורמון פפטיד המיוצר על ידי רירית המעי העליון ונמצא במערכת העצבים המרכזית. זה ממריץ התכווצות כיס המרה, שחרור אנזימי הלבלב ומשפיע על תהליכים שונים במערכת העיכול.

CGRP

פפטיד קשור לגן קלציטונין (CGRP) הוא 37-פפטיד חומצת אמינו הקשור לקלציטונין, עמילין ואדרנומדולין. זה קיים בשתי צורות, -CGRP (CGRP I) ו-CGRP (CGRP II), עם פעילויות ביולוגיות דומות. CGRP נמצא בעיקר בנוירונים תחושתיים ומרכזיים, המשפיעים על תפקוד הלב וכלי הדם, חילוף החומרים של סידן וטונוס כלי הדם של העובר. הקולטנים שלו מקושרים לחלבון G ומפעילים אדנילאט ציקלאז, תוך אינטראקציה עם חלבונים המשתנים פעילות קולטן (RAMPs) עבור ספציפיות ליגנד וסחר תאי.

צ'ה

L-Cyclohexylalanine (Cha) הוא אנלוג חומצות אמינו לא קוטביות של פנילאלנין, כאשר הטבעת הארומטית מוחלפת בטבעת ציקלוהקסאן. החלפה זו מאפשרת ללמוד את תפקידן של חומצות אמינו ארומטיות באינטראקציות כגון אינטראקציות π-π על ידי החלפת שאריות פנילאלנין בצ'ה בניסויים.

שינוי

L- -ציקלוהקסילגליצין (Chg) היא חומצת אמינו לא קוטבית המוגבלת באופן סטרי. הוא משמש כתוצר ביניים פרמצבטי משמעותי ונמצא גם במוצרים טבעיים.

כולסטרול

הכולסטרול מיוצר באופן טבעי על ידי הכבד ותאים אחרים בגוף, אך הוא יכול להגיע גם מהמזון שאנו אוכלים, במיוחד ממוצרים מן החי כמו בשר, עוף ומוצרי חלב מלאי שומן. ניתן לקשר כולסטרול לפפטידים כדי לשפר את הפרמקוקינטיקה.

Cis-Hyp

cis-Hydroxyproline, הסטריאואיזומר של טרנס-הידרוקסיפרולין טבעי.

Cit

ציטרולין קיים בחלבונים כתוצאה משינוי אנזימטי לאחר תרגום של שאריות ארגינין.

CMK

CMK הוא מעכב קינאז RSK2 בעל עוצמה דומה אך פחות יציבות כימית מאשר FMK.

CNP

פפטיד נטריאורטי מסוג C (CNP) הוא פפטיד על ידי תאי אנדותל כלי דם, הידוע בהשפעותיו המרחיבות כלי דם. הוא מציג קווי דמיון מבניים ופיזיולוגיים לפפטידים נטריאורטיים פרוזדורים ומוח (ANP ו-BNP).

Cpg

L- -Cyclopentylglycyl (Cpg), היא חומצת אמינו לא קוטבית המוגבלת באופן סטרי.

סי-טרמינל

ברצף פפטיד, אותו שייר ייחודי המחובר לרצף הליניארי על ידי קבוצת האמינו שלו, ומשאיר אותו עם קבוצת קרבוקסי חופשית. קבוצת הקרבוקסיל של שארית זו יכולה לעבור שינויים כגון amidation או, במקרים כמו pyroglutamate, lactamization פנימי.

Cy3

ציאנין 3 הוא צבע ציאנין אדום ניאון הנמרץ בדרך כלל על ידי מקור אור בסביבות 558 ננומטר ופולט אור ב-572 ננומטר בערך.

Cy5

ציאנין 5 הוא פלואורופור צבע ציאנין הפולט פלואורסצנטיות כמעט אינפרא אדום הנרגשת בדרך כלל על ידי מקור אור בסביבות 646 ננומטר ופולטת אור בכ-664 ננומטר.

טְפִיחָה

L-, -Diaminobutyric חומצה היא חומצת ,ω-דיאמינו, אנלוגי קצר יותר של אורניתין (Orn) וליזין (Lys). עם הגנה מתאימה, ניתן לשנות באופן סלקטיבי חומצות ,ω-דיאמינו במיקום Nω שלהן או לשלב אותן כדי ליצור פפטידים מסועפים או דנדרמרים.

DABCYL

3-(Dimethylaminoazo)benzene-4-חומצה קרבוקסילית, היא כרומופור המקושר לקבוצות אמינו המשמשות ביישומי ביוכימיה וביולוגיה מולקולרית כמרווה בהעברת אנרגיית תהודה פלואורסצנטית (FRET), למשל עם EDANS. עירור של DABCYL ב-454 ננומטר.

דבסיל

Dabsyl ,4-dimethylaminobenzenesulfonyl chloride, כרומופור המקושר לקבוצות אמינו המשמשות כמרווה בשילוב, למשל עם EDANS. עירור של Dabsyl ב-436 ננומטר.

DANSYL

4-דימתילאמינו-1-נפטלן-סולפוניל, פלואורפור המקושר לקבוצות אמינו, עירור ב-342 ננומטר, פליטה ב-562 ננומטר.

דאפ

L-, -Diaminopropionic acid (Dap או Dpr) היא חומצת ,ω-דיאמינו, שהיא אנלוגיה קצרה יותר של חומצה דיאמינובוטירית (Dab), אורניתין (Orn) וליזין (Lys). ניתן לשנות באופן סלקטיבי נגזרות מתוקנות של חומצות ,ω-דיאמינו במיקום ה-Nω שלהן או לשלב אותן כדי ליצור פפטידים מסועפים או דנדרמרים.

דדה

1-(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)ethyl (Dde) היא קבוצה המגנה על אמינו המשמשת בסינתזת פפטידים. ניתן לבקע אותו באופן סלקטיבי באמצעות 2% הידראזין הידראט בדימתילפורמאמיד (DMF). Nω-Dde מאפשר הסרה ספציפית של Dde מחומצות אמינו כגון Dap, Dab, Orn או Lys לאחר Fmoc solid-phase peptide synthesis (SPPS), מה שמקל על שינוי שרף של קבוצת האמינו Nω.

דיסולפיד

קשרי דיסולפיד הם קשרים קוולנטיים הנוצרים בין שתי קבוצות סולפהדריל (-SH) של שיירי ציסטאין בחלבונים.

Dmb

2,4-dimethoxybenzyl היא קבוצת הגנה על פורמאמיד חסרת חומצה המשמשת לשינוי עמוד השדרה הפיך בסינתזה של פפטידים. הם משולבים במהלך סינתזת פפטיד מוצק (SPPS) כחומצת האמינו או הדיפפטיד Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), כאשר Fmoc מונע צבירה של פפטיד ובכך מקדם התארכות יעילה. Dmb גם מעודד תגובות מחזוריות ומונע היווצרות אספרגימיד. בניגוד לנגזרות Hmb, Dmb אינו יוצר בנזוקסאזפינים במהלך ההפעלה.

Dnp - 2,4-דיניטרופניל

2,4-דיניטרופניל הוא כרומופור המצומד לקבוצות אמינו, המשמש בדרך כלל כמרווה במצעים של העברת אנרגיה תהודה פלואורסצנטית (FRET).

דוד

4,4′-Dimethoxydityl, הידוע גם בשם bis-(4-methoxyphenyl)methyl, הוא קבוצת הגנה על קרבוקסאמידים עמידים בחומצה התואמת לסינתזת פפטידים מוצקים של Fmoc (SPPS).

DOPA

DOPA, 3,4-dihydroxyphenylalanine, הוא מבשר למספר נוירוטרנסמיטורים חיוניים, כולל דופמין, נוראפינפרין ואפינפרין.

DOTA

(4,7,10-Tricarboxymethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecyl)-חומצה אצטית, בקיצור DOTA, היא קלטור מחזורי המחובר בדרך כלל לקצה ה-N של פפטידים. DOTA מקל על סימון פפטידים עם רדיונוקלידים כגון 68Ga או 90Y עבור יישומים ביו-רפואיים שונים, כולל הדמיה וטיפול ממוקד.

Dpm

דיפנילמתיל (דיטיל), קבוצה מגנה על N-, O- ו-S חסר חומצה.

DTPA

חומצה Diethylenetriaminepentaacetic (DTPA) היא חומר קלתי שימושי עבור רדיונוקלידים כגון (68)Ga, (99m)Tc ו-(111)In, אשר ישימים להדמיה ברפואה גרעינית.

EDANS

חומצה 5-[(2-Aminoethyl)amino]naphthalene-1-סולפונית (EDANS) היא פלואורפור המקושר בדרך כלל ל-Nω של חומצות דיאמינו כמו ליזין. הוא משמש לעתים קרובות במצעי FRET, בדרך כלל בשילוב עם מרווה כמו DABCYL. ל-EDANS יש אורך גל עירור של 340 ננומטר ופולט ב-490 ננומטר.

EMAP

פוליפפטיד המפעיל מונוציטים אנדותל.

א.ת

אתיל, קבוצת אלקיל והומלוג של מתיל (Me), משמש לשינויים קבועים של N- ו-S-אתילציה בפפטידים.

מיפוי אפיטופים

מיפוי אפיטופים (מיפוי אפיטופים של אנטיגן) היא טכניקה המשמשת לקביעת האזורים הספציפיים (כלומר, אפיטופים של אנטיגן) על אנטיגן שניתן לזהות על ידי נוגדנים או מערכת החיסון. ניתן לחלק אפיטופים של אנטיגן לאפיטופים ליניאריים ואפיטופים קונפורמטיביים. באמצעות מיפוי אפיטופים של אנטיגן, אנו יכולים להבין לעומק את הקשר בין המבנה והתפקוד של האנטיגן, שהוא בעל משמעות רבה בפיתוח חיסונים, אבחון מחלות, אימונותרפיה והיבטים נוספים.
כמה שיטות נפוצות למיפוי אפיטופים של אנטיגן כוללות:
קריסטלוגרפיה של קרני רנטגן: זה יכול לנתח ישירות את המבנה התלת מימדי של האנטיגן, ובכך לקבוע את מיקומו של האפיטופ.
תהודה מגנטית גרעינית: ניתן להשתמש בה גם כדי לנתח את מבנה האנטיגן כדי לקבוע את האפיטופ.
טכניקת סריקת פפטידים: שימוש בסדרה של מקטעי פפטיד סינתטיים חופפים לזיהוי האפיטופ הנקשר לנוגדן.
לדוגמה, במחקר ופיתוח חיסונים, הבהרת האפיטופים המרכזיים על האנטיגן עוזרת לעצב חיסונים יעילים יותר ולעורר תגובה חיסונית ממוקדת יותר; באבחון מחלות, קביעת האפיטופים של האנטיגן הקשורים למחלות ספציפיות יכולה לפתח ריאגנטים אבחוניים מדויקים יותר.

5-FAM

5-FAM (5-Carboxyfluorescein) הוא פלואורפור נפוץ לתיוג ביומולקולות, עם אורך גל עירור של 490 ננומטר ופליטות ב-520 ננומטר.

6-FAM

פלואורשאין-6-קרבוניל הוא פלואורפור המחובר לקבוצות אמינו, עם אורך גל עירור של 490 ננומטר ופליטה ב-520 ננומטר.

FITC

Fluorescein isothiocyanate (FITC) הוא פלואורפור המגיב עם קבוצות אמינו. כאשר מתייגים פפטיד בקצה ה-N שלו עם FITC, בדרך כלל ניתן להכניס מרווח כמו -alanine או Ahx. ל-FITC אורך גל עירור של 490 ננומטר ופליטה ב-520 ננומטר.

9-Fluorenylmethyl היא קבוצת הגנה בלתי עמידה לבסיס המשמשת להגנת O- ו-S.

FMK

FMK, fluoromethyl ketone, הוא מעכב בלתי הפיך של קינאז RSK2.

Fmoc

9-Fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), קבוצת ההגנה האמינית בסינתזה של FMOC פאזה מוצקה, ניתנת להסרה באמצעות 20% פיפרידין/DMF.

עֲבוּר

פורמיל היא קבוצת הגנה על אינדול המשמשת ב-Boc-SPPS. Trp(For) מבוקע על ידי HF בנוכחות מרקפטן או על ידי בסיסים כגון פיפרידין.

לִדאוֹג

העברת אנרגיית תהודה פלואורסצנטית (FRET) היא העברת אנרגיה לא קרינה מפלואורפור נרגש (תורם) למקבל מתאים (מרווה). ההעברה תלויה במרחק, כיוון דיפול וחפיפה ספקטרלית של התורם והמקבל. במצעי FRET, הפלואורופור והמרווה מקושרים באמצעות שרשרת פפטידים. מחשוף אנזימטי מגביר את הקרינה על ידי הפרדת התורם והמקבל.

פלוּאוֹרסצֵנצִיָה

פלואורסצנציה היא האור הנפלט על ידי חומר הסופג אור או קרינה אלקטרומגנטית אחרת. זה מתרחש כאשר מולקולות הנקראות פלואורפורים סופגות פוטונים באורך גל מסוים, מתרגשות ואז פולטות פוטונים וחוזרות למצב הקרקע שלהן. לאור הנפלט יש בדרך כלל אורך גל ארוך יותר ואנרגיה נמוכה יותר מהאור הנקלט, וכתוצאה מכך ספקטרום פלואורסצנטי אופייני. תופעה זו נמצאת בשימוש נרחב למגוון מטרות מדעיות ורפואיות, כולל מיקרוסקופיה, ציטומטריית זרימה וספקטרוסקופיה פלואורסצנטית.

GIP

פוליפפטיד מעכב קיבה (GIP), הידוע גם כפפטיד אינסולינוטרופי תלוי-גלוקוז, שייך למשפחת ההורמונים ה-secretin. הוא ממריץ הפרשת אינסולין, מעכב הפרשת חומצת קיבה, וממלא תפקיד מכריע בוויסות הפרשת האינסולין וההומאוסטזיס של גלוקוז.

גל

L- -חומצה קרבוקסיגלוטמית (Gla) נוצרת באמצעות קרבוקסילציה פוסט-תרגום של חומצה גלוטמית, וכתוצאה מכך חלבונים המסוגלים לקשור יוני סידן, כגון אוסטאוקלצין. פפטידים המכילים Gla מסונתזים באופן אידיאלי באמצעות Fmoc solid-phase peptidesynthesis (SPPS), שכן Gla יכולה לעבור דה-קרבוקסילציה כדי להניב חומצה גלוטמית בנוכחות חומצות חזקות.

GLP

פפטידים דמויי גלוקגון הם חברים במשפחת העל של הגלוקגון של הורמוני פפטידים שמקורם באזור C-terminal של פרוגלוקגון. הם מסונתזים בעיקר על ידי תאי L במעיים.

GnRH

הורמון משחרר גונדוטרופין (LHRH) הוא הורמון דקאפפטיד המיוצר בתאים נוירו-הפרשתיים של ההיפותלמוס ומשוחרר בהתפרצויות פועם אל מחזור השער של יותרת המוח. הפרשת פעימות היא קריטית לתפקודי רבייה, התפתחות מינית ובידול.

GRF

הורמון משחרר הורמון גדילה (GHRH), הידוע גם בשם סומטורין, הוא הורמון פפטיד היפותלמוס הממריץ את בלוטת יותרת המוח לשחרר ולסנתז הורמון גדילה.

GRP

HLA

אנטיגן לויקוציטים אנושיים (HLA) מתייחס לקבוצה של חלבונים הנמצאים על פני התאים הממלאים תפקיד מכריע בזיהוי של חומרים זרים של מערכת החיסון. הם מקודדים על ידי הגנים העיקריים של תסביך ההיסטו-תאימות (MHC) בבני אדם וחיוניים להצגת אנטיגנים לתאי T, מה שמאפשר למערכת החיסון להבחין בין תאים עצמיים ותאים שאינם עצמיים. מולקולות HLA מגוונות מאוד ופולימורפיות, תורמות באופן משמעותי לתגובות חיסוניות אינדיבידואליות ולרגישות למחלות אוטואימוניות ודחיית השתלות.

המב

2-הידרוקסי-4-מתוקסי-בנזיל היא קבוצת הגנה לא-לאבילית של פורמאמיד המשמשת לשינוי עמוד השדרה הפיך בסינתזה של פפטידים. הוא משולב כחומצת אמינו או דיפפטיד Fmoc-Hmb (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) במהלך סינתזת פפטיד Fmoc בשלב מוצק (SPPS), מונע צבירה ומאפשר הרחבת פפטיד יעילה. Hmb גם מסייע בתגובות מחזוריות ומונע היווצרות אספרגין.

הר

L-Homoarginine הוא הומלוג של L-arginine, המקוצר כ-Har, וניתן למצוא אותו בפלזמה ובשתן. הומוארגינין הוא תוצאה של גואנידינציה של ליזין, שניתן לבצע גם על פפטידים וחלבונים.

Hci

הומוציטרולין הוא הומלוג של L-ציטרולין, המקוצר כ-Hci, וניתן לזהות אותו בשתן אנושי.

Hcy

L-homocysteine הוא הומלוג של ציסטאין, המקוצר כ-Hcy, והוא מיוצר על ידי דה-מתילציה של מתיונין. רמות גבוהות של Hcy בדם מהוות גורם סיכון למחלות לב וכלי דם ונוירודגנרטיביות. בניגוד לנגזרות Cys, נגזרות Hcy אינן מבצעות גזע במהלך הצימוד, וכך גם -elimin.

Hle

הומולוגים של L-leucine, בקיצור Hle.

Hph

Homophenylalanine, הומולוג של פנילאלנין, המקוצר כ-Hph, הוא מרכיב של מעכבי ACE ורנין. Fmoc-Homophe-OH היא תרופה אנטי דלקתית פוטנציאלית.

Hpr

L-homoproline או L-picolic acid, בקיצור Pip או Hpr. ההומלוג Hpr של פרולין הוא תוצר פירוק של L-ליזין. ניתן לזהות את שני האננטיומרים בפלזמה אנושית. מאחר ושאריות פרולין משפיעות מאוד על הקונפורמציה של הפפטיד, החלפת Pro ב-Hpr (או חומצה קרבוקסילית Azetidine-2-(Aze)) יכולה לשנות את המבנה המשני שלו.

הייפ

L-transhydroxyproline מיוצר לאחר תרגום על ידי חמצון של פרולין. היפ הוא מרכיב עיקרי של קולגן וחלבון מולים.

איזוזירין

איזוזרין, איזומר של L-סרין, היא חומצת אמינו.

IvDde

ivDde, קבוצה המגנה על אמינו, ניתן להסיר את ההגנה ולבקע על ידי 2% הידראזין הידראזין ב-DMF. ivDde יציב יותר מ-Dde לטיפולי פיפרידין מרובים במהלך Fmoc-SPPS. ניתן להסיר Nω-ivDde באופן סלקטיבי מ-Dap, Dab Orn או Lys, מה שמאפשר שינוי על-שרף לאחר סינתטי של קבוצת ה-Nω-amino.

KLH

ה-Keyhole limpet hemocyanin (KLH) הוא מטאלופרוטאין רב-יחידות גדול נושא חמצן המצוי בהמולימפה של המוציאנין ענק של חור המנעול. כנשא אנטיגן, KLH משפר בדרך כלל את האימונוגניות ויכולות קיבוע האנטיגן על ידי צימוד רצפי פוליפפטיד מטרה, המקדם באופן משמעותי את היצירה של נוגדנים יעילים, ספציפיים ופונקציונליים.

LHRH

הורמון משחרר הורמון luteinizing hormone-releasing (LHRH או GnRH) הוא הורמון דקאפפטיד המסונתז על ידי תאים נוירו-הפרשים בתוך ההיפותלמוס ומשוחרר בפועם לתוך מחזור השער של יותרת המוח. הפרשת פעימות היא קריטית לתפקוד הרבייה, התפתחות מינית ובידול.

מקשר

בתכנון וסינתזה של פפטידים, חוקרים יכולים להכניס מקשר בין הביוטין או הפלורסנט לבין הפפטידים. מרווח הידרופובי נפוץ הוא חומצה aminohexanoic (Ahx), ומרווח הידרופילי נפוץ הוא פולי(אתילן) גליקול (PEG).

ליאופיליזציה

תהליך ייבוש בהקפאה, המסיר נוזלים מחומרים רגישים לחום. החומר מוקפא, מונח תחת ואקום גבוה ונשמר בטמפרטורות נמוכות. הלחץ שנוצר מהוואקום גורם לקרח לעבור ממצב מוצק לגזי מבלי לעבור דרך המצב הנוזלי. פפטידים מועברים בדרך כלל כאבקה lyofilized.

LC-MS

כרומטוגרפיה נוזלית-ספקטרומטריית מסה היא טכניקה אנליטית רב-תכליתית המשלבת כרומטוגרפיה נוזלית עם ספקטרומטריית מסה כדי לספק מידע מפורט על ההרכב והמבנה של מולקולות בתוך דגימות מורכבות.

מפות

פפטידים אנטיגנים מרובים. פפטיד מרובה אנטיגן הוא דרך חזקה אחת לייצר נוגדנים אנטי-פפטידיים בטיטר גבוה וחיסוני פפטיד סינתטיים.

MALDI-MS

ספקטרומטריית מסה (MALDI-MS) בסיוע לייזר (MALDI-MS) היא טכניקה אנליטית המשמשת למדידת יחס מסה למטען של יונים. זה שימושי במיוחד לניתוח של ביומולקולות כמו פפטידים, חלבונים ופולימרים.

ספקטרומטריית מסה

ספקטרומטריית מסה (MS) היא טכניקה אנליטית רבת עוצמה המשמשת למדידת יחס מסה למטען (m/z) של יונים.

4M NA

4-מתוקסי- -נפתילאמיד, המקוצר כ-MNA, הוא פלואורופור המחובר בדרך כלל למצע קרבוקסיפפטידאז בקצה ה-C. 4M NA מפוצל מעורר ב-335-350 ננומטר ופולט ב-410-440 ננומטר

Mbs

Methoxybenzenesulfonyl (Mbs) היא קבוצת הגנה על גואנידיל המשמשת בסינתזת פפטידים מוצקים מבוססי Boc (Boc-SPPS). ניתן להסיר את ההגנה על קבוצת הגנה זו על ידי מחשוף עם מימן פלואוריד (HF).

מבזל

4-מתיל-בנזיל (Mbzl) היא קבוצת הגנה על סולפהדריל המשמשת בסינתזת פפטידים מוצקים מבוססי Boc (Boc-SPPS). Mbzl יציב יותר מ- methoxybenzyl (Mob) בטיפולים תכופים של חומצה טריפלואוראצטית (TFA) וניתן להסירו על ידי מחשוף מימן פלואוריד (HF).

מק'ה

חומצה (7-Methoxycoumarin-4-yl)אצטית (Mca) היא פלואורפור שניתן לקשר לקבוצת אמינו.
Mca נקשר לדיניטרופניל (Dnp) עבור מצעים להעברת אנרגיית תהודה פלואורסצנטית (FRET). אורך גל העירור הוא 325 ננומטר, ואורך גל הפליטה הוא 392 ננומטר.

MCH

הורמון ריכוז המלנין (MCH) הוא נוירופפטיד מחזורי שבודד לראשונה מדגים וחולדות. MCH מעורב בעיקר בוויסות פיגמנטציה של העור בדגי טלאוסט והתנהגות האכלה ביונקים.

לִי

מתיל, תחליף האלקיל הפשוט ביותר, מעורב במתילציה של N-, O- ו-S, המהווים שינויים קבועים של הפפטיד.

MeOSuc

3-Methoxysuccinyl, המקביל ל-Asp(OMe) דה-אמינציה, היא קבוצה חוסמת N-טרמינלית קוטבית המשולבת בדרך כלל במצעים של carboxypeptidase.

מתילציה

מתילציה היא שינוי פוסט-תרגום (PTM) של פפטידים וחלבונים כאשר קבוצת מתיל (-CH3) מתווספת אנזימטית לשאריות חומצות אמינו ספציפיות, בדרך כלל ליזין (Lys), ארגינין (Arg), היסטידין (His) או גלוטמט ( גלו). שינוי זה יכול להשפיע באופן משמעותי על תפקוד חלבון, יציבות ואינטראקציות עם מולקולות אחרות, ובכך למלא תפקידים מרכזיים בוויסות תהליכים תאיים מגוונים, כולל ביטוי גנים, העברת אותות ואינטראקציות חלבון-חלבון.

MHC

קומפלקס ההיסטו-תאימות העיקרי (MHC) הוא אזור גנטי המכיל גנים המקודדים למולקולות MHC. למולקולות אלו תפקיד מכריע במערכת החיסון ובאוטואימוניות. בבני אדם, קומפלקס זה ידוע גם כמערכת אנטיגן לויקוציטים אנושיים (HLA).

MHC I

מולקולות MHC class I (MHC I) הן חלבונים על משטחי תאים המציגים פפטידים מתוך התא לתאי T ציטוטוקסיים. זה עוזר לתאי החיסון לזהות ולהרוס תאים נגועים או לא תקינים, חיוני להגנה חיסונית מפני פתוגנים וסרטן.

MHC II

מולקולות MHC class II (MHC II) הן חלבונים משטח התא המציגים פפטידים המופקים מחומרים זרים לתאי T עוזרים. אינטראקציה זו חיונית לתיאום תגובות חיסון והפעלת תאי חיסון אחרים כנגד פתוגנים.

ארגינין מונו-מתילציה

ארגינין מונומתיל (MMA) הוא שינוי שלאחר תרגום שבו קבוצת מתיל בודדת (-CH3) מתווספת אנזימטית לחנקן הגואנידינו של שארית ארגינין בתוך פפטיד או חלבון

Mpa

3-מרקפטופרופילמין, יכול לשמש כליגנד פפטיד או כמשנה ביישומים ביוכימיים וביו-רפואיים שונים.

מיר

מיריסטואילציה היא תהליך שינוי שומנים שבו קבוצת מיריסטואיל, המורכבת מחומצת שומן רוויה 14-בפחמן, מקושרת באופן קוולנטי לקצה ה-N של הפפטיד. שינוי זה משמש לעיגון החלבון לממברנת התא, ומקל על הלוקליזציה שלו והשתתפותו בתהליכים תאיים מגוונים.

1-נאל

-(1-naphthyl)-L-alanine היא נגזרת חומצת אמינו לא קוטבית הדומה ל-phenylalanine, אך עם קבוצת נפתיל במקום קבוצת פניל.

2-נאל

-(2-נפתיל)אלנין היא נגזרת חומצת אמינו לא קוטבית הדומה לפנילאלנין, אך עם קבוצת נפתיל במקום קבוצת פניל.

נ.ב.ד

3-nitrobenz-2-oxa-1, 3-דיאזול (NBD) מוכנס בדרך כלל על ידי צימוד המגיב NBD-Cl לפפטיד. פפטידים המסומנים ב-NBD נבחרים באופן נרחב בשל שימושם במחקרים המתמקדים בממברנות ובביולוגיה של התא.

NHEt

N-Ethylamide יכול להיחשב כצורה decarboxylated של אלנין C-terminal. ב-LHRH אגוניסט buserelin, NHEt משמש כאנלוג של גליצינאמיד C-terminal. פפטיד N-אתילמיד עמיד בפני פירוק על ידי carboxypeptidases.

Nle

L-norleucine (Nle) הוא איזוסטר יציב של L-methionine. כאשר הפעילות הביולוגית של פפטיד נפגעת עקב היווצרות sulfoxide, ניתן להחליף את Nle ב-Met מבלי לשנות בדרך כלל את ההתנהגות התפקודית שלו.

NOTA

NOTA, 1,4, 7- triazacyclononane -1, 4, 7- חומצה טריאקטית, הוא קלטור דו -פונקציונאלי המשמש מסגרת לבניית כלי הדמיה לחיות מחמד. הוא מנוצל גם בתכנון בדיקה והגברת אותות באמצעות השפעות רב ערכיות ומחזיק ביישומים פוטנציאליים כתרופה רדיו-פרמצבטית אבחנתית של גליום.

N-Me

N-Me מתייחס בדרך כלל ל-N-methylation, שינוי כימי שבו קבוצת מתיל (-CH 3 ) מחוברת לאטום חנקן במולקולה, כגון N-Me-Gly, N-Me-Ser, N-Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me-Val, N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva וכו'.

NODAGA

NODAGA,1,4,7-triazacyclononane,1-חומצה גלוטארית-4,7-חומצה דיאצטית, היא קלטור דו-פונקציונלי יוצא מן הכלל לתכנון ופיתוח של תרופות רדיו-מתכתיות אורגנו-מתכתיות, המציעות תרופות משמעותיות פוטנציאל ליישומים בהדמיה אבחנתית והקרנות ממוקדות.

Nps

2-Nitrophenylthio (Nps) היא קבוצת S-הגנה המשמשת בסינתזת פפטידים מוצקים מבוססי Boc (Boc-SPPS). זה יכול להיות מבוקע על ידי תיולים, במיוחד דרך קבוצת sulfhydryl חופשית של ציסטאין (Cys), מה שמוביל להיווצרות בו-זמנית של קשר דיסולפיד.

NPY

נוירופפטיד Y (NPY) הוא נוירופפטיד בולט במוח וחלק ממשפחת הנוירופפטיד Y, הכוללת פוליפפטיד לבלב (PP) ופפטיד YY (PYY).

Npys

2-Nitro-2-pyridylsulfenyl (Npys) היא קבוצת הגנה על S התואמת לסינתזת פפטידים מוצקים (Boc-SPPS) מבוססת Boc. ניתן לפצל Npys על ידי תיולים, במיוחד דרך קבוצת הסולפהידריל החופשית של ציסטאין (Cys), וכתוצאה מכך נוצר בו-זמנית של קשר דיסולפיד.

נווה

Norvaline היא חומצת אמינו אליפטית לא קוטבית והומולוגית של חומצה -aminobutyric (Abu).

-Naphthylamide הוא פלואורופור נפוץ במצעי carboxypeptidase, מקושר בדרך כלל בקצה C של פפטידים. NA מפוצל מרגש ב-330 ננומטר ופולט ב-370 ננומטר.

-Naphthylamide הוא פלואורופור נפוץ במצעי carboxypeptidase, מקושר בדרך כלל בקצה C של פפטידים. NA מקולק ב-320-340 ננומטר, פליטה ב-410-420 ננומטר.

OAll

Allyl ester הוא קבוצת הגנה על קרבוקסיל התואמת הן לסינתזת פפטידים מוצקים על בסיס Fmoc והן על בסיס Boc (SPPS). בדומה לאלוק, ניתן להסיר באופן סלקטיבי אסטרים אליליים על ידי טיפול ב-Pd(PPh3)4. ב-Fmoc-SPPS, Asp(OAll) רגיש להיווצרות מזורזת בסיס של אספרטמיד.

OBzl

בנזיל אסטר, קבוצת הגנה קרבוקסילית, ניתן להסיר על ידי הידרוגנציה קטליטית (למשל H2/Pd) או חומצות חזקות.

OcHex

OcHex היא קבוצת ההגנה הסטנדרטית לקרבוקסיל המשמשת בסינתזת פפטידים מוצקים מבוססי Boc (Boc-SPPS).

ODmab

4-(N-[1(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-ethylbutyl]amino)benzyl ester (ODmab) הוא מגן קרבוקסילי קבוצה המשמשת בסינתזת פפטידים מוצקים מבוססי Fmoc (Fmoc-SPPS). ניתן לבקע ולהסיר את ההגנה באמצעות 2% הידראזין הידראט ב-DMF.

ODmb

2,4-אסטר Dimethoxybenzyl הוא קבוצת הגנה קרבוקסילית עמידה בחומצה גבוהה שניתן להסירה באמצעות 1% TFA בדיכורומתאן.

OEt

אתיל אסטר, בשל התנאים המחמירים הנדרשים להסרת אתיל אסטרים, שינוי פפטידים עם אתיל אסטרים יכול לשפר את הליפופיליות והיציבות שלהם.

OFm

9-אסטר פלואורניל-מתיל הוא קבוצת הגנה קרבוקסילית בלתי-לאבילית לבסיס, שניתן להסיר באמצעות פיפרידין ב-DMF.

OHex

אסטרים Hexyl, בשל התנאים המחמירים הנדרשים להסרת אתיל אסטרים, שינוי פפטידים עם אתיל אסטרים יכול לשפר את הליפופיליות והיציבות שלהם.

אויק

L-Otahydroindole-2-חומצה קרבוקסילית (Oic) היא חומצת אמינו מופרעת לא קוטבית. החדרת חומצת אמינו זו הקשורה לפרולין לרצף הפוליפפטיד משפיעה מאוד על הקונפורמציה של הפפטיד.

אה

אסטרים מתיל הם קבוצות הגנה חצי-קבועות ב-C-terminal בסינתזה של שלב נוזלי, וניתן להמיר אותם לפפטידים הידראזידים, מבשרים של אזידים פפטידים תגובתיים. צימוד אזיד נותר שיטת הצימוד הפופולרית ביותר בסינתזה של פפטידים בשלב נוזלי.

OMpe

3-מתילפנט-3-יל אסטר (OMpe) היא קבוצת הגנה קרבוקסילית בלתי עמידה בחומצה המשמשת לעתים קרובות כדי להגן על קבוצת הקרבוקסיל של חומצה אספרטית (Asp) בסינתזת פפטידים מוצקים מבוססי Fmoc (Fmoc-SPPS ). אנלוגי טרט-בוטיל אסטר תובעני יותר זה פותח במיוחד כדי להפחית היווצרות אספרגימיד מזורזת בסיס.

ONp

אסטרים אורתו-ניטרופניל של חומצות אמינו Boc או Z הם נגזרות מופעלות מראש המשמשות בסינתזה של תמיסת פפטידים.

אורן

Ornithine (Orn) מופק מארגינין במהלך מחזור האוריאה וניתן לראות אותו גם בפפטידים כתוצר פירוק של ארגינין. יצירת עפר באמצעות אצילציה של חלק הגואנידין של ארגינין היא תגובת לוואי שכיחה בסינתזה של פפטידים.

OSu

Hydroxysuccinimide ester (OSu, בקיצור NHS) הוא נגזרת חומצת אמינו מופעלת מראש, המשמשת בדרך כלל בסינתזה של פפטידים, במיוחד שינוי פפטידים. אסטרים של OSu בטוחים, לא סטריים, תואמים למערכות מימיות וקלים לטיפול.

OtBu - אסטר t-Butyl

Tert-butyl ester, קבוצת הגנה קרבוקסילית בלתי תקינה לחומצה לחומצות אמינו בסינתזה של פפטידים.

PABA

4-חומצה אמינו-בנזואית (חומצה פארא-אמינו-בנזואית), ניתן להשתמש לסינתזה של קישורים מצומדים של נוגדנים-תרופות. לדוגמה, Mal-PEG2-Val-Cit-PABA הוא מקשר ל-ADC (Conjugate Conjugate Conjugate).

PABC

PABC (para-aminobenzyl carbamate) היא תרכובת כימית המשמשת בסינתזה של מצומדים של נוגדנים-תרופות (ADCs) כמקשר. זה מקל על הצמדת תרופות לנוגדנים בצורה מבוקרת, ומאפשר מתן תרופות ממוקדות בטיפולי סרטן ויישומים ביו-רפואיים אחרים. לדוגמה, Mc-Val-Cit-PABC-PNP הוא מקשר הניתן לפירוק קתפסין המשמש בצימודים של נוגדנים-תרופות (ADCs).

PACAP

פוליפפטיד מפעיל יותרת המוח אדנילט ציקלאז (PACAP) הוא נוירופפטיד שמור מאוד המתבטא בצורה בולטת בכל מוח היונקים. הוא מפעיל את השפעותיו הביולוגיות על ידי שיפור רמות AMP מחזוריות תוך-תאיות באמצעות אינטראקציה עם קולטן.

פאם

פלמיטויל, קבוצת אציל לא קוטבית המוכנסת בקצה ה-N או בצד. פלמיטוילציה נצפתה גם כשינוי פוסט-תרגום של חלבונים.

PAM

Phenylacetamide methyl resin הוא שרף שתוכנן במיוחד עבור סינתזת פפטידים מוצקים מבוססי Boc (Boc-SPPS). פפטידים המסונתזים על שרף זה יכולים להשתחרר באמצעות מחשוף HF.

מטען

ב- Antibody-Drug Conjugates (ADCs), המקשר מחבר את הנוגדן למטען הציטוטוקסי. בחירת המטען היא קריטית שכן היא קובעת את היעילות והספציפיות של ADCs במתן טיפול לרקמות היעד באמצעות מנגנוני שחרור ספציפיים.

Pbf

2,2,4,6,7-Pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonyl (Pbf) היא קבוצת ההגנה המועדפת על גואנידינו המשמשת בסינתזת פפטידים מוצקים מבוססי Fmoc (Fmoc-SPPS). הוא מציג רגישות חומצה מעט גבוהה יותר בהשוואה ל- Pmc.

עֵט

פניצילאמין הוא אנלוגי של L-cysteine המאופיין בהחלפת קבוצת מתיל (-CH3) בחומצה קרבוקסילית (-COOH).

הרכבה עצמית של פפטיד

הרכבה עצמית של פפטידים היא כאשר פפטידים מסדרים את עצמם באופן טבעי למבנים מסודרים ללא התערבות חיצונית. תהליך זה מונע על ידי אינטראקציות לא קוולנטיות כגון קשרי מימן, אינטראקציות הידרופוביות, כוחות אלקטרוסטטיים וערימה π-π. הרכבה עצמית של פפטידים יכולה להוביל ליצירת ננו-מבנים שונים כולל סיבים, כדורים, יריעות וג'לים, שיש להם יישומים במדעי החומרים, ביוטכנולוגיה ורפואה.

פנילק

פנילאצטיל (Phenylac או Phac) היא קבוצת אציל הקשורה בדרך כלל בקצה ה-N של פפטידים, המאופיינת בקוטביות נמוכה יותר בהשוואה לאצטיל (Ac). זה מהווה שינוי קבוע של פפטידים.

Phg

פנילגליצין (Phg) היא נגזרת חומצת אמינו שבה קבוצת פניל מחליפה את אטום המימן במולקולת הגליצין

PHI

Peptide Histidine Isoleucine (PHI), פפטיד חזיר הקשור ל-VIP ול-Secretin.

PHM

פפטיד היסטידין מתיונין (PHM), פפטיד אנושי הקשור ל-VIP.

פַּיִי

הנקודה האיזואלקטרית (pI) מוגדרת כרמת ה-pH שבה לחלבון/פפטיד יש מטען נטו של אפס (Smoluch et al., 2016).

Pmc

2,2,5,7,8-Pentamethylchroman-6-sulfonyl (Pmc) היא קבוצת הגנה גואנידיניל בשימוש נפוץ בסינתזת פפטידים מוצקים מבוססי Fmoc (Fmoc-SPPS). זה מצוין כי הוא מעט פחות רגיש לחומצה בהשוואה ל-Pbf.

pNA

p-Nitroaniline, כרומופור, מצומד בדרך כלל לקצה ה-C של מצעי carboxypeptidase. ספיגת ה-p-nitroaniline המשוחררת נמדדת בדרך כלל באורכי גל סביב 405 או 410 ננומטר.

פרא

L-Propargylglycine (Pra) מיוצר על ידי מיקרואורגניזמים. חומצת אמינו זו, המאופיינת במבנה הקשר המשולש שלה, נחשבת מאוד כיחידת יסוד לסינתזה של פפטידים המסוגלת לעסוק בתגובות "קליקים כימיה", וזוכה לתשומת לב משמעותית בשטח.

pTH

הורמון הפרתירואיד (PTH) הוא הורמון פפטיד המשוחרר מבלוטות התריס, חיוני לשמירה על הומאוסטזיס של סידן וזרחן בנוזל החוץ-תאי.

PTMs

שינויים פוסט-תרגום (PTMs) של חלבונים מוסיפים קבוצות פונקציונליות או חלבונים, חותכים תת-יחידות רגולטוריות או מפרקים חלבונים שלמים. שינויים אלה, כמו זרחון, גליקוזילציה, מתילציה, אצטילציה, שומנים, יוביקוויטינציה, ניטרוסילציה ופרוטאוליזה, משפיעים על האופן שבו תאים פועלים כרגיל ובמהלך מחלה. הבנת PTMs חיונית למחקר בסיסי ולמציאת טיפולים חדשים.

פיר

חומצה פירוגלוטמית, ידועה גם בקיצורים כגון Pgl, Glp, pGlu, או

phenylazobenzylmethoxycarbonyl היא קבוצת N-הגנה כרומופורית המשמשת בסינתזת פפטידים, הניתנת לפירוק על ידי הידרוגנציה קטליטית או חומצה חזקה. הוא מציג אורכי גל ספיגה מקסימליים ב-229 ננומטר, 320 ננומטר ו-441 ננומטר.

זוגות מרווה

זוג מרווה מורכב ממולקולת פלואורסצנטית (פלואורופור) וממולקולת מרווה המשמשת במחקר ומבחנים מבוססי פלואורסצנטי. המרווה סופג את האור הנפלט מהפלואורופור, ומפחית את הקרינה שלו. כאשר הפלואורופור והמרווה מופרדים, כגון באמצעות תגובה ביוכימית, אות הקרינה עולה. זה מאפשר לחוקרים למדוד שינויים ואינטראקציות בזמן אמת. טכניקה זו משמשת בדרך כלל ביישומים כמו PCR בזמן אמת, בדיקות מולקולריות ומבחני FRET (Förster Resonance Energy Transfer).

רדיוליגנדים

פלואור-18 הוא רדיוליגנד נפוץ בהדמיית PET להערכת חילוף החומרים של גלוקוז ברקמות והוא נפוץ בשימוש באבחון סרטן ובהדמיית מוח.

ספריית פפטידים אקראית

ספריית פפטידים אקראית היא אוסף של רצפי פפטידים קצרים רבים שנוצרו באופן אקראי. לכל פפטיד בספרייה יש מספר ספציפי של חומצות אמינו עם רצפים שנקבעו באקראי, היוצרים מגוון מגוון של מולקולות פפטיד. חוקרים משתמשים בספריות אלה כדי לסנן פפטידים בעלי תכונות ספציפיות, פעילויות ביולוגיות או אינטראקציות עם מולקולות מטרה. הם שימושיים במיוחד בגילוי תרופות, אימונולוגיה ומחקרים של אינטראקציות חלבון-חלבון, עוזרים לזהות תרופות טיפוליות חדשות והבנת תהליכים ביולוגיים מורכבים.

שאריות

שארית היא חומצת אמינו בודדת בתוך פפטיד או חלבון. כאשר חומצות אמינו מתחברות זו לזו באמצעות קשרים פפטידים ליצירת שרשראות אלה, כל יחידת חומצות אמינו נקראת שייר. משתמשים במונח זה מכיוון שבמהלך היווצרות הקשר הפפטיד, כל חומצת אמינו מאבדת מולקולת מים (H2O), ומשאירה אחריה מה שמכונה שארית.

שְׂרָף

שרף הוא פולימר בלתי מסיס המשמש בסינתזת פפטידים מוצקים (SPPS) כתמיכה מוצקה לתוספת מתמשכת של חומצות אמינו. חרוזי שרף מספקים משטח יציב ואינרטי שאליו מחוברות חומצות האמינו הראשוניות באופן קוולנטי, מה שמאפשר לשרשרת הפפטידים להיבנות שאריות אחר שאריות.

רודאמין ב

Rhodamine B הוא צבע ורוד עד אדום בוהק עם אורך גל עירור בדרך כלל סביב 540-570 ננומטר וטווח אור שנפלט של 560-580 ננומטר. בדרך כלל הוא מצומד לרצף הפפטידים באמצעות קבוצת האמינו ה-N-טרמינלית של הפפטיד

RP-HPLC

כרומטוגרף נוזלי בעל ביצועים גבוהים בפאזה הפוכה.

SAR

תרופות ליחסי מבנה-פעילות (SAR) מפותחות על ידי לימוד הקשר בין המבנה הכימי של התרופה לבין הפעילות הביולוגית שלה.

שר

סרקוזין, חומצת האמינו הפשוטה ביותר עם N-אלקילציה.

SDMA

דימתילארגינין סימטרי(SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (סימטרי) יכול לשמש ישירות לסינתזה של פפטידים המכילים דימתילארגינין סימטרי.

SPPS

סינתזת פפטידים מוצקים (SPPS) היא שיטה לסינתזה כימית של פפטידים, שבה פפטידים מורכבים בדרגה על משטח מוצק או שרף על ידי הוספת חומצות אמינו מוגנות ברצף. SPPS מקיף שתי אסטרטגיות: Fmoc-SPPS ו-Boc-SPPS, אשר נבדלות בבחירתן של קבוצות הגנה על קבוצות N-אמינו (Fmoc או Boc) וקבוצות הגנה על שרשרת צד. סוג קבוצת ההגנה של N-אמינו שנבחר מכתיב את אסטרטגיית ההגנה על שרשרת הצד ואת התנאים לביקוע הסופי של הפפטיד מהשרף.

Sta

סטטין, בקיצור Sta, היא חומצת אמינו שאינה חלבונית המשמשת לעתים קרובות בעיצוב של חומרי חיקוי פפטידים, במיוחד בסינתזה של מעכבי פרוטאז.

StBu

Tert-Butylthio (StBu) היא קבוצה מגנת S אשר מבוקעת על ידי הפחתת פוספין ותואמת ל-Boc-SPPS.

Suc

סוצ'יניל הוא שינוי קוטבי N-טרמינלי התואם לאספרטאט מפורק ומשולב בדרך כלל במצעי קרבוקסיפפטידאז.

תמרה

TAMRA, המקוצר גם בשם TMR, הוא פלואורפור שניתן לחבר לקבוצת אמינו. הוא משמש לעתים קרובות בשילוב עם FAM עבור מצעי FRET. ל-TAMRA אורך גל עירור של 485 ננומטר ואורך גל פליטה של 535 ננומטר.

tBu

טרט-בוטיל היא קבוצת הגנה נטולת חומצה בשימוש נפוץ עבור אלכוהולים ופנולים, אותם ניתן לפצל באמצעות חומצה טריפלואורית (TFA).

תה

Triethylammonium phosphate הוא חיץ המשמש בשלבים ניידים של HPLC הפוכים.

TFA

חומצה Trifluoroacetic (TFA) שימשה עבור ביקוע פפטיד משרף ב-Fmoc-SPPS ולהסרת קבוצות הגנה שמקורן ב-tBu.

TFMSA

חומצה טריפלואורומתאן-סולפונית (TFMSA) היא חומצה חזקה יותר מ-TFA. TFMSA יכול לשמש כחלופה בטוחה יותר ל-HF רעיל ביותר עבור שלב המחשוף הסופי של אסטרטגיית Boc-SPPS.

טל

L-tert-leucine (Tle) היא חומצת אמינו לא קוטבית עם שרשראות צד תובעניות סטריית שמערערת את היציבות -סלילים.

Tmob

2,4,6-Trimethoxybenzyl היא קבוצת הגנה לא-לאבילית לחומצה Asn ו-Gln amid המשמשת ב-Fmoc-SPPS.

תוס'

Tosyl משמש כקבוצת הגנה לגואנידין ואימידאזול ב-Boc-SPPS, וניתן להסירו על ידי Na/NH3

Trt

Trityl (Trt) היא קבוצת הגנה חסרת חומצה המשמשת לשאריות Asn, Cys, Gln ו-His ב-Fmoc-SPPS. ניתן להסירו באופן סלקטיבי באמצעות חומצה טריפלואוראצטית (TFA).

אבקה ליופיליזית לבנה

פפטידים טהורים קיימים בדרך כלל במצב אבקה לבנה לאחר ייבוש בהקפאה.

VIP

פפטיד מעי ואזואקטיבי (VIP) הוא 28-פפטיד חומצות אמינו השייך למשפחת העל של פפטיד גלוקגון-גרלין-secretin.

Xan

9-Xanthydryl (Xan) היא קבוצת הגנה על אמידים עמידים בחומצה המשמשת לשאריות Asn ו-Gln ב-Boc-SPPS. ניתן להסיר את Xan באופן סלקטיבי באמצעות TFA.

אבקה ליופיליזית צהובה

כאשר הפפטיד מסומן ב-FAM fluorescein, האבקה הליופילית מציגה בדרך כלל מראה צהוב.

Z-benzyloxycarbonyl, המקוצר כ-Z או Cbz, משמש כקבוצה המגנה על אמינו בסינתזה של פפטידים. ניתן להסיר אותו באמצעות הידרוגנוליזה או חומצות חזקות כמו HF מסודר או HBr/חומצה אצטית.

אַגְרוֹן

טלפון

כתובת

דוא

אַגְרוֹן