בעיות נפוצות בסינתזה של פפטידים

הבעיות והפתרונות הנפוצים בתהליך סינתזת פפטידים כוללים את ההיבטים הבאים:

תכולת פפטיד: תכולת פפטיד מתייחסת לאחוז החומרים הפפטידים בדגימה ביחס לחומרים שאינם פפטידים. במוצרי פפטידים, בנוסף לפפטיד עצמו, כלולים גם רכיבים שאינם מלחים המוכנסים בתהליך הייצור, כגון מים, ממיסים נספגים, יוני קואורדינציה ומלחים.

יציבות כימית:

תגובת Deamidation: שאריות Asn/Gln עוברות הידרוליזה בקלות ליצירת Asp/Glu.
הידרוליזה: קשרי פפטיד בפפטידים נשברים בקלות על ידי הידרוליזה, במיוחד אלו הנוצרים על ידי השתתפות Asp, במיוחד קשרי פפטיד Asp Pro ו- Asp Gly.
תגובת גזע: לכל שיירי חומצות האמינו מלבד Gly יש אטומי פחמן אלפא כיראליים והם נוטים לתגובת גזע תחת קטליזה אלקלית. שאריות אספ נוטות ביותר לתגובות גזע.
- פירוק אלימינציה: Cys, Ser, Thr, Phe, Tyr ושאריות אחרות יכולים להתפרק באמצעות - חיסול, שסביר יותר להתרחש ב-pH בסיסי ומושפע מטמפרטורה ומיוני מתכת
יציבות פיזית:

דנטורציה, ספיחה, צבירה או משקעים: דנטורציה של פפטידים קשורה בדרך כלל להרס של המבנים השלישוניים והמשניים. במצב הדנטורטי, פפטידים נוטים יותר לתגובות כימיות וקשה לשחזר את פעילותם. החומר הביניים הנוצר במהלך תהליך הדנטורציה הוא בעל מסיסות נמוכה והוא נוטה להצטברות ולמשקעים
שְׁמִירָה:

תנאי האחסון הטובים ביותר: פפטידים מאוחסנים בדרך כלל בצורה של אבקה מיובשת בהקפאה, שהיא יציבה מאוד ב--20 מעלות, במיוחד לאחר ייבוש בהקפאה ומאוחסנת במייבש של -20 מעלות. ניתן לאחסן את רוב הפפטידים בטמפרטורה זו למשך מספר שנים ללא שינוי. כדי להפחית את השפעת הלחות, יש להחזיר פפטידים מיובשים בהקפאה לטמפרטורת החדר בתנאים יבשים לפני שהם נחשפים לאוויר.
אריזה: Hesheng Biotechnology ממליצה על אריזות קטנות כדי להימנע ממחזורי הקפאה-הפשרה חוזרים, להפחית את מספר הפתחים והסגירות של המיכלים, ובכך להפחית את הסיכויים לטיפול לא נכון או זיהום חיידקי ולהבטיח את יציבות הפפטידים.
בדיקת טוהר:

הבטחת טוהר: כל הפפטידים שנמסרו הגיעו לטוהר הנדרש, ופפטידים שאינם עומדים בתקן יסולקו. תוצאות זיהוי HPLC ו-MS יכולות לאמת את הטוהר והמשקל המולקולרי של הפפטיד, תוך הצגת הזיהומים העיקריים.
שיטות זיהוי אחרות, כגון ניתוח חומצות אמינו או ניתוח אלמנטים, יכולות לאשר את הרכב חומצות האמינו של פפטידים כאמצעי משלים לאישור פפטידים
טכנולוגיית סינתזה:

סינתזת פפטידים שלב מוצק: סינתזת פפטיד שלב מוצק אינה דורשת טיהור של מוצרי ביניים, מה שמאפשר תהליכי סינתזה מתמשכים ומניח את הבסיס לאוטומציה של סינתזת פפטיד. בהתבסס על סינתזה כימית של Fmoc, פפטיד המטרה סונתז על ידי קישור קוולנטי של קבוצת הקרבוקסיל של חומצת האמינו המסוף C עם שרף פולימרי בלתי מסיס, ולאחר מכן החל מקבוצת האמינו של חומצת האמינו
התוכן לעיל מסכם בעיות ואמצעי נגד נפוצים בסינתזת פפטידים, מכסה היבטים מרובים כגון יציבות כימית, יציבות פיזית, תנאי אחסון, בדיקות טוהר וכו'.